把转录因子像奥利奥一样劈成两半:Stanley Fields 如何在酵母细胞核里抓到蛋白质“谈恋爱”?
1989 年 11月22日 · 酵母双杂交系统(Yeast Two-Hybrid, Y2H)、GAL4-BD/AD 载体与 SD/-Leu/-Trp/-His 缺陷型平板
你知道吗?
怎么知道两个看不见的分子有没有在黑暗的细胞核里偷偷拥抱?Fields 给它俩一人塞了半截手电筒,只要它俩一抱紧,整个酵母菌落就亮成了蓝色。
在 1989 年之前,如果你想证明细胞里的蛋白 X 和蛋白 Y 能结合在一起,你必须先把细胞磨碎裂解,用昂贵的抗体去做免疫共沉淀(Co-IP)或者化学交联——这不仅需要极其耗时的蛋白纯化,而且很多在活细胞里只是短暂一抱的弱相互作用,一出细胞门就被裂解液冲散了。
能不能不破膜、直接让活细胞自己汇报“哪两个蛋白在谈恋爱”?1989 年 11 月,纽约州立大学石溪分校的年轻助理教授斯坦利·菲尔兹(Stanley Fields)与博士后 Ok-kyu Song 在《Nature》上发表了一篇仅两页半、却彻底改写现代分子生物学的神作——酵母双杂交(Yeast Two-Hybrid, Y2H)!
他们的灵感来自哈佛大学 Mark Ptashne 此前对酵母半乳糖转录因子 GAL4 的解剖:GAL4 蛋白其实是个由两个独立零件拼起来的“乐高积木”——上半身叫 DNA 结合域(BD),只负责像船锚一样抓住启动子 DNA,但不会开启转录;下半身叫 转录激活域(AD),只负责招呼 RNA 聚合酶来干活,但自己找不到 DNA 在哪。
Fields 一拍大腿:如果我把 GAL4 从中间一刀劈成两半,把上半身 BD 融合在你的“诱饵蛋白 X(Bait)”上,把下半身 AD 融合在“猎物蛋白 Y(Prey)”上,一起转进酵母里会怎样?如果 X 和 Y 互不理睬,劈成两半的 GAL4 永远无法合体;一旦 X 和 Y 在酵母细胞核里情投意合抱在一起,BD 和 AD 就被顺便拉到了咫尺之间,瞬间重组成完整的转录开关,点亮下游的 LacZ(让菌落变蓝)或组氨酸合成基因!
这项绝妙的“分子拆分互补(Split-protein)”思想,后来更衍生出了双分子荧光互补(BiFC)与分裂荧光素酶等无数传奇工具。