质谱室里的福尔摩斯探案集：为什么冬天的人类细胞样本里，总会测出绵羊角蛋白和护手霜？
2008 年 10月25日 · 无粉丁腈手套、质谱级试剂与 MaxQuant 常见污染库（contaminants.fasta）
你知道吗？
在飞摩尔级灵敏度的质谱仪眼里，你不仅没穿衣服，连你今天穿了哪件起球的澳大利亚美利奴羊毛衫、早上抹了哪个牌子的护手霜都写在了谱图上。
每个刚接触蛋白质组学（LC-MS/MS）的研究生，都经历过被质谱平台老师指着搜库结果灵魂拷问的社死时刻：“老实交代，你明明养的是小鼠细胞，为什么鉴定得分最高的前十个蛋白全是人类角蛋白（Keratin），甚至还排进了绵羊角蛋白（Ovis aries）？
”千万别怀疑细胞系被羊污染了——真相是做实验那天正好降温，你白大褂里面穿了一件羊毛衫！在高灵敏度的 Orbitrap 质谱仪面前，由于没有 PCR 那样的特异性引物扩增，任何飞进 EP 管里的纳米级尘埃都会被一视同仁地电离检测。
实验员头皮脱落的一片皮屑、说话飘出的一粒唾液飞沫、甚至冬天袖口摩擦掉下的一根微米级羊毛纤维，被胰酶切开后都会变成铺天盖地的角蛋白肽段，把你真正想测的低丰度信号蛋白彻底淹没。更可怕的是化学高分子污染：如果你早上涂了含聚乙二醇（PEG）的护手霜没戴好手套，谱图上就会长出一排间隔精准等于 44.026 Da（-CH2CH2O- 重复单元）的密集“梳子峰”！
正因如此，2008 年 Keller 等人系统汇编了质谱污染图谱，而 MaxQuant 软件更内置了著名的 contaminants.fasta 黑名单，专门帮你过滤掉羊毛衫和头皮屑的幽灵。