去垢剂的暴脾气与温柔乡:为什么做 Co-IP 用了强 RIPA 裂解液,互作蛋白就全跑光了?
1973 年 7月15日 · SDS、Triton X-100、NP-40 与 RIPA 细胞裂解液
你知道吗?
SDS 是冲进屋里把房梁和夫妻俩一起拆成零件的暴力拆迁队,而 Triton X-100 只是悄悄拆掉泥巴外墙、让屋里手拉手的小情侣毫发无伤的温柔搬家工。
实验室里经常发生这样的惨案:师弟想做免疫共沉淀(Co-IP)验证蛋白 A 和蛋白 B 手拉手结合在一起,结果他图省事,直接拿平时跑 Western Blot 提总蛋白用的强 RIPA 裂解液(含高浓度 SDS 和脱氧胆酸钠)去裂解细胞。
最后跑胶一看,诱饵蛋白 A 抓下来一大堆,互作蛋白 B 却连个鬼影都没有!为什么?这完全取决于你手里的“去垢剂(Detergent,俗称表面活性剂)”到底是个莽夫还是个绅士!1973 至 1975 年间,芬兰生物化学家 Ari Helenius 与 Kai Simons 发表了阐明去垢剂与膜蛋白相互作用的奠基性综述。
去垢剂分子都是一头亲水、一头疏水的“两面派”,但脾气天差地别:像 SDS(十二烷基硫酸钠)这种头部带负电的强阴离子去垢剂,简直是拆家狼牙棒——它的单体不仅能融化细胞膜,还会强行钻进蛋白质肚子里的疏水核心,靠静电斥力把蛋白质的三维折叠撑爆成一根直挺挺的面条,原本靠微弱氢键和疏水力抱在一起的 A 和 B 当场劳燕分飞!
相反,像 Triton X-100 或 NP-40 这类头部不带电的非离子去垢剂则是温柔的绅士,它们的临界胶束浓度(CMC)很低,只会像替身演员一样温和地顶替掉细胞膜上的磷脂分子,把蛋白质完好无损地从膜上“请”进水里,连最脆弱的蛋白复合体都能紧紧牵着手不散伙。