数亿碱基中唯一的纯净一刀:斯托达德与 LAGLIDADG 归巢内切酶重塑
2001 年 9月15日 · 结晶纯化 I-SceI / I-CreI 归巢内切酶、带有 18 bp 罕见识别位点的打靶载体与变性测序胶
你知道吗?
真正的微创手术不是在伤口上反复缝补,而是在整座城市的车流中,唯独切断那一颗失控的火花塞。
在讨论基因编辑的脱靶毒性(Off-target)时,科学家最梦寐以求的是一把具有绝对物理专一性的超长剪刀。早在内含子流动机制研究中,科学家就在酵母线粒体中发现了一类罕见的自私遗传元件编码蛋白——巨核酸酶(Meganuclease,又称归巢内切酶)。
其中最负盛名的莫过于I-SceI与I-CreI。以巴里·斯托达德为代表的结构生物学家通过高分辨率X射线晶体衍射,揭示了其核心保守的“LAGLIDADG”催化模体构架。与限制酶只能看清6个碱基不同,单个天然归巢内切酶能够一口气包裹并识别长达18至30个碱基的连续特异性DNA序列!
在统计概率上,一个18 bp的随机序列在人类30亿碱基基因组中平均需要几十个基因组才会偶然出现一次,这意味着在正常人类细胞中,这柄酶切剪刀的天然切点数量为零,具有无可比拟的纯净度。斯托达德团队通过半理性蛋白质工程,对LAGLIDADG核心催化口袋周围数十个与DNA主链接触的氨基酸进行组合诱变与计算筛选,成功重塑其识别特异性,使其能够精准切向人类治病突变位点,为超高保真基因编辑树立了难以逾越的结构美学典范。