跑不动的重装分子坦克:加纳与雷夫津发明 EMSA 凝胶阻滞迁移实验
1981 年 7月10日 · 非变性天然聚丙烯酰胺垂直凝胶板、放射性/荧光标记 DNA 探针与聚(dI-dC)非特异竞争剂
你知道吗?
生命间最强烈的羁绊,就是甘愿在奔赴正极的电泳洪流里,为你放慢奔跑的脚步。
研究蛋白质与核酸的物理相互作用时,科学家一直苦于没有一种快速、简便且无需昂贵超速离心机的定性定量分析工具。1981年密歇根州立大学的玛格丽特·加纳与阿诺德·雷夫津在分析大肠杆菌乳糖操纵子阻遏蛋白(LacI)时,利用凝胶介质的分子筛效应奠定了凝胶迁移阻滞实验(EMSA)的经典操作框架。
他们将一段带有同位素标记的特异性双链启动子探针,与核提取物或纯化蛋白质在含有甘油的低盐缓冲液中冰浴结合。为了消除粗提物中海量杂蛋白与带负电荷DNA探针发生的电荷非特异吸附,他们神来之笔地加入了大量无害的人工非特异竞争子——聚肌苷酸-聚胞苷酸(Poly(dI-dC))。
当将反应液上样至完全不含SDS或尿素等变性剂的非变性天然聚丙烯酰胺垂直凝胶中通电泳动时,游离的裸露小探针因电荷比大、摩擦阻力小而迅速飞奔向凝胶底端;而一旦探针被转录因子特异识别抱紧,复合体的水动力学半径暴增且净负电荷被蛋白质部分抵消,宛如背负巨石的坦克在网孔中艰难蠕动,在凝胶高处形成一条截然分明、大幅滞后的“阻滞带”。