熏得眼泪直流的变性甲醛胶:阿尔温与斯塔克发明 Northern 印迹透视转录流
1977 年 12月1日 · 含 2.2 M 甲醛的变性琼脂糖水平凝胶、甲酰胺加载缓冲液与重氮苯氧甲基(DBM)/ 尼龙带电转印膜
你知道吗?
在通风橱里忍受刺鼻的甲醛蒸汽,是每一个老派分子生物学家灵魂深处的成人礼。
在Southern印迹让DNA检测大获全胜后,分子生物学家迫切渴望对活细胞中转录活跃的mRNA分子进行同样的定性定量分析。然而RNA分子是一群脾气极度暴躁的单链分子:它们不仅极易被实验台无处不在的微量RNase瞬间啃碎,更致命的是,单链RNA分子会在分子内部自发配对折叠成极度紧凑且不可预测的发夹、茎环等复杂二级结构,导致在普通电泳中迁移速率完全不能反映其实际分子量!
1977年斯坦福大学的詹姆斯·阿尔温与乔治·斯塔克在萨瑟恩印迹的启发下,幽默地将其对应命名为“Northern印迹”。他们向琼脂糖凝胶中强制灌注高浓度的甲醛,并用去离子甲酰胺配制上样缓冲液。甲醛能够特异性与RNA碱基上的氨基形成交联加合物,彻底拆散所有沃森-克里克氢键配对,将RNA强行拉直成刚性的线性单链构象,使其在电场中严格按真实分子量大小筛选迁移。
随后将其吸印转运到带正电荷的尼龙膜上进行放射性探针杂交,人类从此拥有了第一面能够实时透视特定基因转录表达丰度的分子镜子。